Predição in silico de candidato vacinal multi-epítopo antigênico tumoral para o antígeno testicular de câncer - TFDP3
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Data
2024-02-19
Autores
Currículo Lattes
http://lattes.cnpq.br/4616126871302845
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Editor
UNIVERSIDADE FEDERAL DE ALAGOAS - Ufal
Resumo
O aumento na incidência e mortalidade de câncer no mundo tem demonstrado a necessidade de investimentos em terapias antitumorais mais efetivas. Diante da complexidade dos mecanismos que levam a resistência aos tratamentos antitumorais, as terapias-alvo são abordagens promissoras. Os antígenos testiculares de câncer (CTAs) são alvos terapêuticos com potencial de serem explorados, pois não são expressos em células normais e expressos em células tumorais, como é o caso do TFDP3, expresso em câncer de mama subtipo triplo negativo, próstata, leucemia linfoblástica de célula T infantil e carcinoma hepatocelular. O objetivo proposto nesse trabalho é a predição in silico de um candidato vacinal multi-epítopo antigênico tumoral a partir do TFDP3. A triagem dos epítopos foi realizada com ferramentas de imunoinformática que identificaram os epítopos antigênicos que interagiam com os linfócitos B, linfócitos T CD4+ e linfócitos T CD8+. Em seguida, foi avaliado a cobertura populacional dos epítopos dos linfócitos T CD4+ e linfócitos T CD8+. A partir dos epítopos dos linfócitos B, linfócitos TCD4+ e linfócitos T CD8+ foram selecionados 3 epítopos de cada um deles para compor a vacina multi-epítopo determinados pela antigenicidade, alergenicidade, toxicidade, indução de IFN-γ e cobertura populacional. A vacina foi constituída além dos epítopos por um adjuvante e ligantes que garantiram algumas propriedades dos epítopos, o processamento deles na biosíntese do MHC de classe I e modificações pós-traducionais. A homologia da vacina em relação a outras proteínas foi avaliada pelo servidor NCBI BLASTp. A partir disso, foram avaliados os parâmetros físico-químicos, antigenicidade, alergenicidade e toxicidade. Através de servidores que utilizam redes neurais foi determinado a estrutura secundária e a estrutura terciária assim como os parâmetros de qualidade associados à estrutura. Na estrutura terciária foram determinados os epítopos lineares e descontínuos dos linfócitos B pelo servidor IEDB. A partir daí, foi avaliada a interação por ancoragem molecular com os receptores semelhantes a Toll e a dinâmica molecular para avaliar a estabilidade da vacina multi-epítopo num sistema biológico. Por fim, foi avaliado in silico a viabilidade de clonagem da vacina multi-epítopo e sua resposta imune mediante 1 e 3 administrações sucessivas. Foram identificados epítopos que interagem com os linfócitos B, linfócitos T CD4+ e linfócitos T CD8+ antigênicos, não alergênicos e não tóxicos. Em relação aos linfócitos T CD4+, 4 epítopos além de serem antigênicos, não alergênicos e não tóxico, são possíveis indutores de IFN-γ em relação a cobertura populacional os epítopos do MHC de classe I e MHC de classe II tiveram uma cobertura de 93,55% no mundo. A vacina multi-epítopo tem parâmetros físico-químicos favoráveis biologicamente, baixa homologia com proteínas humanas, conformação secundária e terciária compatível com estruturas de proteínas nativas. Também possui interações com os TLR-2 e TLR-3, sendo o TLR-3 a interação que num sistema biológico garante mais estabilidade da vacina multi-epítopo. Além disso, análises in silico demonstraram que a vacina multi-epítopo pode ser clonada e desenvolver resposta imune mais robusta e duradoura quando submetida a 3 administrações. Portanto, a vacina multi-epítopo desenhada a partir do antígeno testicular de câncer TFDP3 apresentou in silico diversas propriedades e respostas biológicas promissoras para que seja investido estudos in vitro e in vivo e a aplicação no futuro dessa vacina no tratamento de tipos de câncer que expressam esse CTA.
Descrição
Palavras-chave
Neoplasias, Imunoinformática, Predição de epítopos, Vacinas de subunidades, Câncer, Cancer, Immunoinformatics, Epitope prediction, Peptide vaccine
Citação
Omena Neta, Genilda Castro de.
Predição in silico de candidato vacinal multi-epítopo antigênico tumoral para o antígeno testicular de câncer-TFDP3 / Genilda Castro de Omena Neta. – 2024.
143 f. : il., tabs. color.
Orientador: Carlos Alberto de Carvalho Fraga.
Co-orientadora: Caroline de Sales Marques.
Tese (doutorado em ciências) – Universidade Federal de Alagoas. Instituto de Ciências Farmacêuticas. Programa Multicêntrico de Bioquímica e Biologia Molecular. Maceió, 2024.
Bibliografia: f. 99-111.
Apêndices: f. 112-143.
1. Neoplasias. 2. Imunoinformática. 3. Predição de epítopos. 4. Vacinas de
subunidades. I. Título.